免费电动自行车车停车位商用一般不合法。具体分析如下：

首先，免费电动自行车车停车位通常是为了满足居民或公众的停车需求而设立的，其性质和使用目的具有明确的公益性。如果将这些停车位改为商用，如用于经营、出租或作为其他商业用途，就违背了其原有的公益性质和使用目的。

其次，从法律角度来看，改变停车位的使用性质可能涉及违反相关法律法规。例如，如果停车位位于小区内，可能受到《物业管理条例》等法规的约束。这些法规通常规定，小区内的公共设施和场地应当用于服务小区居民，不得擅自改变用途。

此外，即使停车位不在小区内，也可能受到城市规划、土地使用等法律法规的限制。商用停车位需要符合特定的规划和使用要求，而免费电动自行车车停车位通常并不具备这些条件。

因此，从法律层面和实际操作层面来看，免费电动自行车车停车位商用一般是不合法的。如果你面临这样的情况，建议咨询当地相关部门或法律专业人士，以获取更具体的法律意见和帮助。同时，也建议广大市民遵守相关法律法规和规定，共同维护公共设施和场地的正常使用秩序。