被告在未经法院指令的情况下，确实不能擅自查阅某些证据，这主要涉及到证据的合法性和程序正当性问题。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 证据收集的合法性：

   • 在诉讼过程中，证据的收集必须遵循法定程序。被告若想获取某些证据，尤其是涉及对方隐私、商业秘密或国家机密的证据，必须获得法院的许可。这是为了保护各方当事人的合法权益，防止证据被非法获取或滥用。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。这表明，证据的收集并非完全由当事人自行决定，而是需要遵循一定的法律程序。

2. 法院指令的重要性：

   • 法院指令是确保证据收集合法性和程序正当性的关键。当被告认为需要查阅某些证据以支持其辩护时，应向法院提出申请，由法院决定是否准许。
   • 实践意义：法院在审查申请时，会综合考虑证据的相关性、必要性以及可能对各方当事人造成的影响。只有法院认为查阅证据是必要且合法的，才会发出指令允许被告查阅。

3. 未经法院指令查阅证据的后果：

   • 如果被告未经法院指令擅自查阅证据，可能会面临证据被排除的风险。即，在诉讼过程中，该证据可能不被法院采纳，从而影响被告的辩护效果。
   • 法律责任：此外，被告还可能因侵犯他人隐私、商业秘密或国家机密等而承担法律责任。这包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。

4. 建议与应对措施：

   • 申请法院调查取证：被告若认为需要查阅某些证据，应首先向法院提出申请，说明查阅证据的必要性和合法性。法院在审查后，会决定是否发出指令允许查阅。
   • 利用合法途径获取证据：在等待法院指令期间，被告可以通过其他合法途径获取证据，如公开信息、第三方证言等。这些证据同样可以在诉讼过程中发挥重要作用。
   • 咨询专业律师：在整个过程中，被告应咨询专业律师的意见。律师可以根据案件的具体情况，为被告提供合法的证据收集策略和辩护方案。

综上所述，被告在未经法院指令的情况下不能擅自查阅某些证据。为了确保诉讼的顺利进行和自身权益的保障，被告应遵循法定程序申请查阅证据，并在必要时咨询专业律师的意见。如果你在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。