结论：设计单位乙方在合同签订时，总公司作为合同签订方，而合同里指定收款单位为分公司，这种做法在法律上是可行的，但需满足一定条件并注意相关法律风险。
一、法律可行性分析
合同相对性原则：
- 合同具有相对性，即合同的权利义务原则上仅约束合同当事人。在此情况下，总公司作为合同签订方，是合同的主要责任主体。
- 然而，合同中可以约定由第三方（如分公司）履行某些义务，包括收款。这种约定并不违反合同相对性原则，只要合同各方对此达成一致。
分公司法律地位：
- 分公司是总公司的分支机构，不具有独立的法人资格，但其可以在总公司的授权范围内进行经营活动。
- 分公司可以以自己的名义从事民事活动，包括签订合同和收款，但产生的法律责任最终由总公司承担。
二、需满足的条件
总公司授权：
- 总公司必须明确授权分公司收取合同款项。这种授权可以通过内部决议、授权书或其他形式体现。
- 授权应明确分公司的收款权限、范围及期限，以避免产生纠纷。
合同条款明确：
- 合同中应明确约定收款单位为分公司，并注明分公司的名称、开户银行及账号等信息。
- 合同还应规定，若因收款问题产生纠纷，各方应如何承担责任。
遵守相关法律法规：
- 合同签订和履行应遵守相关法律法规，包括但不限于《公司法》、《合同法》等。
- 若涉及跨境交易或特殊行业，还需遵守相关外汇管理、行业监管等规定。
三、法律风险及防范
责任承担风险：
- 尽管分公司可以收款，但若因分公司行为导致合同违约或产生其他法律责任，最终仍由总公司承担。
- 因此，总公司应对分公司的经营活动进行严格监督和管理，确保其合规经营。
合同履行风险：
- 若合同中未明确约定收款单位为分公司，或约定不明确，可能导致收款过程中的纠纷。
- 为避免此类风险，建议在合同签订前与对方充分沟通，明确收款单位及方式。
税务风险：
- 分公司收款可能涉及税务问题，如发票开具、税款缴纳等。
- 总公司应确保分公司遵守相关税务法规，避免因税务问题产生法律风险。
四、建议
完善合同条款：
- 在合同中明确约定收款单位为分公司，并详细规定收款方式、期限及责任承担等条款。
加强内部管理：
- 总公司应建立健全内部管理制度，对分公司的经营活动进行严格监督和管理。
咨询专业律师：
- 在签订合同前，建议咨询专业律师，以确保合同条款的合法性和有效性。当然，如果你有相关法律问题，也可以直接向我咨询，我专注于涉外纠纷、公司事务领域，能够为你提供专业的法律意见。
综上所述，设计单位乙方在合同签订时指定收款单位为分公司是可行的，但需满足一定条件并注意相关法律风险。通过完善合同条款、加强内部管理和咨询专业律师等措施，可以有效降低法律风险并保障合同顺利履行。