当证人不配合警方查明事实真相时，警方可以采取以下一系列措施来应对：

1. 说服教育：

   • 根据法律规定，证人有义务协助公安机关调查取证。在证人未能履行配合义务时，执法机构应首先通过说服教育引导其自愿配合公安机关进行相关的调查取证工作。
   • 严禁对证人采取任何形式的强制手段或实施传唤程序，除非是由于生理障碍、精神疾病或者未成年等因素导致无法识别是非曲直，亦或是无法准确表达个人意愿的人群。

2. 申请法院证据保全：

   • 如果担心证人日后拒绝出庭或证言发生变化，警方可以向法院提出申请，要求采取查封、扣押、拍照、录音、录像、复制、鉴定等方法来保全证据。
   • 法院有权决定保全方式，以保障诉讼的公正和效率。

3. 申请公证证明：

   • 虽然我国立法在公证方面的层次较低，但民事诉讼法规定，经过法定程序公证证明的法律行为、法律事实和文书，法院应当作为认定事实的根据。
   • 因此，在证人可能拒绝作证的情况下，警方可以引导当事人采取公证的方式，由公证员公证其证言的真实性，以避免证人不出庭导致的举证不能的风险，并确保证言的公信力。

4. 强制到庭与法律制裁：

   • 若证人经公安机关或人民法院通知后，无正当理由拒绝作证，人民法院有权强制其到庭。
   • 对于无正当理由拒绝出庭或出庭后拒绝作证的证人，法院将予以训诫；若情节严重，经院长批准，还可处以十日以下的拘留。

5. 考虑替代性证据收集方式：

   • 在证人拒绝出庭的情况下，警方可以考虑通过其他方式来收集证据，如调取监控录像、询问其他知情人士等，以尽可能还原案件事实。

6. 提供书面证言等替代形式：

   • 若证人存在无法出庭作证的合理情形，如庭审期间身患严重疾病、居所远离开庭地点且交通极为不便等，人民法院可准许其不出庭，但应提供书面证言或其他形式的证据。

作为孙乐洋律师，我建议警方在处理证人不配合的情况时，应充分尊重证人的权利，同时依法采取必要的措施来确保案件的公正审理。如果遇到复杂的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。