总承包项目安全文明施工费报价不合规会导致废标。以下是对此问题的详细分析：
一. 安全文明施工费的性质
安全文明施工费属于不可竞争费用，这意味着在投标过程中，该费用不能作为竞争的标的。根据相关政策法规，如《中华人民共和国招标投标法实施条例》及地方性的《建设工程安全文明施工费计价管理办法》等，安全文明施工费必须在编制设计概算、施工图预算和招标控制价时足额计取，并严格按照招标方设定的控制价格填写。
二. 报价不合规的后果
废标处理：如果投标报价中的安全文明施工费超出了招标控制价中相应的费用，或者未按照招标控制价上的数字来填写，那么该投标申请将被视为无效，即废标。这是因为安全文明施工费的不合规报价被视为对招标文件的不实质性响应。
法律责任：除了废标外，投标人还可能因违反相关法律法规而承担其他法律责任。例如，如果投标人以弄虚作假或其他不正当手段谋取中标，还可能面临行政处罚或民事赔偿等后果。
三. 如何避免报价不合规
仔细阅读招标文件：投标人应仔细阅读招标文件中的相关条款和要求，特别是关于安全文明施工费的规定。确保对招标控制价有准确的理解，并严格按照要求填写投标报价。
合规计算报价：投标人应严格按照当地的相关政策规定计算安全文明施工费。这包括确定正确的计算基数和费率，并遵循相关的计算规则。
内部审核与复核：在提交投标报价前，投标人应进行内部审核与复核，确保报价的准确性和合规性。这包括检查计算过程、核对数据等，以避免因计算错误或疏忽而导致的不合规报价。
我的观点：总承包项目安全文明施工费报价不合规会导致废标，这是由安全文明施工费的不可竞争性质和相关政策法规所决定的。因此，投标人应高度重视该费用的报价工作，确保报价的准确性和合规性，以避免因不合规报价而带来的不利后果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。