有营业执照的村集体合作民宿被强拆，是需要进行赔偿的。以下从不同角度为你详细分析：

法律背景

1. 从物权保护角度：根据《中华人民共和国民法典》等相关法律规定，村集体合作民宿作为合法建造的建筑物，其所有权受法律保护。即使该民宿位于村集体土地上，但只要其建造符合相关规划和土地使用规定，就享有合法的物权。强拆行为侵犯了民宿所有者的物权，应当承担相应的赔偿责任。
2. 从营业执照角度：营业执照是企业合法经营的凭证，有营业执照的村集体合作民宿意味着其具有合法的经营资格。强拆行为导致民宿无法继续经营，不仅造成了建筑物的损失，还造成了经营损失，包括预期利润、员工工资、设备折旧等损失，这些损失都应当纳入赔偿范围。

赔偿范围

1. 建筑物及附属设施损失：强拆行为直接导致民宿建筑物及其附属设施（如装修、设备等）的损坏或灭失，这部分损失应当按照实际价值进行赔偿。可以通过评估机构对建筑物及附属设施进行评估，确定其价值。
2. 经营损失：由于强拆导致民宿无法继续经营，造成的经营损失也应当予以赔偿。经营损失的计算可以参考民宿过去的经营数据，如营业收入、利润等，结合强拆后的剩余经营期限等因素进行合理估算。
3. 搬迁费用：如果民宿需要搬迁，搬迁过程中产生的费用，如运输费、安装费等，也应当由强拆方承担。

赔偿程序

1. 协商解决：在强拆行为发生后，民宿所有者可以与强拆方进行协商，就赔偿事宜达成一致意见。协商过程中，应当保留好相关证据，如强拆现场的照片、视频、经营数据等，以便在协商中维护自己的合法权益。
2. 行政复议或行政诉讼：如果协商不成，民宿所有者可以向相关部门申请行政复议，要求对强拆行为进行审查，并确定赔偿事宜。如果对行政复议结果不满意，还可以向人民法院提起行政诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

法律后果

1. 强拆方责任：如果强拆行为被认定为违法，强拆方不仅需要承担赔偿责任，还可能面临行政处罚甚至刑事责任。例如，如果强拆行为是由政府部门组织实施的，且违反了法定程序，相关责任人员可能会受到行政处分；如果强拆行为造成了严重后果，还可能构成滥用职权罪等犯罪。
2. 民宿所有者权益保障：通过法律途径维护自己的合法权益，民宿所有者可以获得相应的赔偿，弥补因强拆行为造成的损失。同时，也有助于规范强拆行为，保障公民的合法权益。

综上所述，有营业执照的村集体合作民宿被强拆，民宿所有者有权要求强拆方进行赔偿。赔偿范围包括建筑物及附属设施损失、经营损失和搬迁费用等。在赔偿过程中，可以通过协商、行政复议或行政诉讼等方式维护自己的合法权益。如果你在征地拆迁方面还有其他问题，可以直接向我咨询。