针对您提出的“协议既有民事关系条款又有劳动关系条款，该协议应当认定为劳动合同还是民事”这一问题，我们可以从以下几个方面进行深入分析：

1. 协议性质的认定依据：

   • 协议性质的认定，应当根据合同内容所涉及的法律关系，即合同双方所设立的权利义务来进行认定。如果协议中明确包含了劳动关系的相关要素，如工作内容、劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等，且这些要素符合《中华人民共和国劳动合同法》的规定，那么该协议更可能被认定为劳动合同。

2. 案例参考：

   • 以指导案例179号“聂美兰诉北京林氏兄弟文化有限公司确认劳动关系案”为例，该案中双方签订的协议虽然名为“合作设立茶叶经营项目的协议”，但协议内容中明确约定了聘任关系、取酬方式以及聂美兰需接受林氏兄弟公司的管理，这些均符合劳动关系的特征。因此，法院最终认定双方存在劳动关系，并将该协议视为书面劳动合同。

3. 劳动关系与民事关系的区别：

   • 劳动关系强调的是人格从属性和经济从属性，即劳动者需接受用人单位的管理，并按照用人单位的指示提供劳动，同时从用人单位处获得劳动报酬。而民事关系则更侧重于平等主体之间的权利义务关系，双方地位相对平等，不存在明显的从属性。

4. 协议条款的综合考量：

   • 在判断协议性质时，不能仅凭协议名称或部分条款来断定，而应综合考虑协议的全部内容以及双方的实际履行情况。如果协议中既包含了民事关系的条款，又包含了劳动关系的条款，且劳动关系的条款占据主导地位，那么该协议更可能被认定为劳动合同。

5. 法律建议：

   • 对于您所提到的协议，建议您首先仔细审查协议内容，明确其中包含的民事关系条款和劳动关系条款的具体内容。如果劳动关系条款占据主导地位，且符合《中华人民共和国劳动合同法》的规定，那么该协议更可能被认定为劳动合同。此时，如果用人单位未按照劳动合同法的规定与您签订书面劳动合同或履行相关义务，您有权要求用人单位承担相应的法律责任。
   • 如果您对协议性质存在疑问或不确定如何处理，建议您直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。

综上所述，协议既有民事关系条款又有劳动关系条款时，其性质的认定需综合考虑协议内容、双方实际履行情况以及相关法律法规的规定。如果您对此类问题有进一步的疑问或需要专业的法律建议，请随时向我咨询。