核心前提：用户询问在招商银行房贷还款日12点之前存入款项但未扣款是否算逾期。
结论前置：
一般情况下不算逾期：如果用户在还款日当天12点之前已经将款项存入还款账户，但银行由于系统处理等原因未及时扣款，这通常不被视为逾期。因为用户已经履行了还款的义务，即将款项存入了指定账户。
但需关注银行具体规定：然而，不同银行对于还款时间和扣款方式可能有不同的规定。有些银行可能要求在还款日当天某个具体时间点之前完成扣款，才算作按时还款。因此，用户需要仔细查阅与招商银行签订的房贷合同，或者咨询招商银行客服，了解该银行对于还款时间和扣款方式的具体规定。
详细分析：
用户已履行还款义务：从用户的角度来看，他们已经在还款日当天12点之前将款项存入了还款账户，这表明他们已经履行了还款的义务。因此，在一般情况下，这不应该被视为逾期。
银行系统处理可能延迟：银行系统处理扣款可能存在一定的延迟，这可能是由于系统繁忙、网络问题或其他原因导致的。这种延迟通常不被视为用户的过错，因此也不应该导致用户被视为逾期。
需关注合同和银行规定：然而，为了确保自己的权益不受损害，用户需要仔细查阅与银行签订的房贷合同，了解其中关于还款时间和扣款方式的具体规定。同时，用户也可以咨询银行客服，获取更准确的信息。
建议：
如果用户担心自己可能被视为逾期，可以主动联系招商银行客服，说明情况并询问是否需要采取任何额外措施来确保还款被及时记录。
用户也可以考虑在还款日之前提前几天将款项存入还款账户，以避免因系统处理延迟而导致的任何潜在问题。
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