针对您提出的“重大事故扣除责任人怎么处理”这一问题，我将从法律角度出发，为您详细阐述重大事故责任人的处理流程和相关法律依据。

在处理重大事故责任人的过程中，我们首先需要明确的是，这一处理必须严格遵循相关法律法规，确保公正、合法地处理责任人。整个处理流程大致可以分为以下几个阶段：

一、事故调查阶段

1. 成立调查组：在重大事故发生后，通常会由应急管理部门、行业主管部门等牵头，联合公安、监察、工会等部门组成专门的事故调查组，全面负责事故的调查工作。

2. 证据收集与责任认定：调查组会通过现场勘查、询问证人、查阅资料等方式，全面收集事故证据，明确事故发生的直接原因和间接原因，进而确定各责任人的责任类型及大小，包括直接责任、主要责任、重要责任和领导责任。

二、法律责任追究阶段

1. 行政责任：

   • 对于生产经营单位的主要负责人，如果未履行安全生产管理职责导致事故，依据《中华人民共和国安全生产法》的相关规定，将面临上一年年收入百分之八十的罚款。
   • 对于其他负责人及安全管理人员，如果未履行职责或导致事故，也将受到责令改正、罚款、暂停或吊销资格等处罚。
   • 对于事故发生单位及其有关人员的谎报、瞒报、伪造现场、转移财产等行为，将依法给予严厉行政处罚。

2. 刑事责任：

   • 如果责任人违反安全管理规定导致重大伤亡事故，依据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能面临三年以下有期徒刑或拘役；情节特别恶劣者，处三年以上七年以下有期徒刑。
   • 如果事故为重大交通事故，责任人可能面临三年以下有期徒刑或拘役；有逃逸或其他特别恶劣情节者，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡者，处七年以上有期徒刑。

三、民事赔偿阶段

1. 赔偿责任：责任人需对受害者承担民事赔偿责任，包括但不限于医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金及丧葬费等。

2. 赔偿途径：受害者可通过与责任人协商、调解（如人民调解委员会）或提起民事诉讼等方式要求赔偿。若事故涉及单位，单位可能承担连带赔偿责任。

四、其他处理措施

1. 行业禁入：对于严重违反行业规定导致事故的责任人，相关行业主管部门可实施一定期限甚至终身的行业禁入措施。

2. 内部处理：所在单位或企业可根据内部规章制度对责任人进行进一步处理，如警告、降职、撤职或解除劳动合同等。

综上所述，重大事故责任人的处理是一个涉及多个法律领域和行政机构的复杂过程。在处理过程中，应严格遵循相关法律法规的规定，确保处理的公正性、公平性和合法性。同时，也建议相关单位和企业加强安全生产管理，预防类似事故的再次发生。