事故主责车辆被扣留后，可按以下步骤处理：

1. 明确扣车合法性
   根据《道路交通安全法》第72条，交警因收集证据需要可扣留事故车辆，但需出具《行政强制措施凭证》，并告知扣留理由、期限（一般不超过30日，经批准可延长至60日）。若未出具凭证或超期扣留，可向交警部门申诉或申请行政复议。

2. 配合调查与取证
   扣车期间，需配合交警完成现场勘查、询问笔录、车辆技术鉴定等程序。若对鉴定结论有异议（如车速、痕迹等），可在收到结论后3日内申请重新鉴定，费用由申请方垫付，最终由责任方承担。

3. 处理事故责任认定
   交警应在扣车后10日内出具《事故责任认定书》。若对认定结果不服，可在收到后3日内申请复核。主责方需特别注意：认定书是后续赔偿和保险理赔的核心依据，需仔细核对责任划分是否与事实一致。

4. 车辆放行与取回

   • 一般流程：完成调查后，交警会通知领取车辆，需携带身份证、行驶证、交强险保单及《放行通知书》办理。
     
   • 特殊情况：若车辆因检验鉴定被扣留，需在鉴定结论确定后5日内取车；若因赔偿纠纷被暂扣，需与对方协商或通过法院诉讼解决后取车。

5. 赔偿与保险理赔

   • 主责方责任：需承担对方人身伤害（医疗费、误工费等）及财产损失（车辆维修、物品损坏等）的70%以上（具体比例以认定书为准）。
     
   • 保险理赔：及时联系保险公司报案，提交事故认定书、医疗票据、维修清单等材料。若赔偿金额超过交强险限额（死亡伤残18万、医疗1.8万、财产0.2万），需通过商业三者险补充；未投保商业险的，需自行承担超额部分。

6. 争议解决途径
   若与对方就赔偿金额无法达成一致，可：

   • 申请交警调解：在收到认定书后10日内共同申请，调解不成可进入诉讼；
     
   • 直接起诉：向法院提起民事诉讼，需准备证据材料（认定书、医疗记录、维修发票等），诉讼时效为3年。

温馨提示：处理过程中需保留所有书面文件（如认定书、凭证、沟通记录），避免口头协商无凭证。若对流程不熟悉或遇到复杂情况（如对方拒不配合、保险拒赔等），可直接向我咨询，我会结合具体细节提供针对性方案。