针对您提出的“公司法人独资合伙人没有协议有效吗”这一问题，我们可以从以下几个方面进行深入分析：

1. 合伙关系有效性的认定：

   • 在法律层面，合伙关系的认定并不完全依赖于书面协议的存在。即使没有书面协议，只要合伙人之间存在共同出资、共享收益、共担风险等合伙特征，并且有相关证据（如证人证言）能够证明口头合伙协议的存在，人民法院仍然可以认定合伙关系成立。

2. 法律依据：

   • 根据《民法典》及相关司法解释，若当事人之间既无书面合伙协议，也未经工商行政管理部门核准登记，但满足合伙的其他条件（如共同出资、共同经营、共享收益、共担风险），并且有两个以上无利害关系人能证明存在口头合伙协议，那么人民法院可以认定其存在合伙关系。

3. 实际案例分析：

   • 以您提到的“公司法人独资合伙人”情境为例，如果公司法人作为独资方与另一合伙人（无论是自然人还是法人）之间没有签订书面合伙协议，但双方实际上按照合伙的方式进行了共同出资、共同经营、共享收益和共担风险，并且有相关证据能够证明这一点，那么这种合伙关系在法律上是可以被认定的。

4. 法律建议：

   • 尽管没有书面协议的合伙关系在法律上可能被认定，但为了避免日后产生纠纷，建议合伙人之间最好签订完善的书面合伙协议。在协议中明确各方的权利和义务、利润分配的方式、亏损承担的比例等重要事项，以此来保障自身的合法权益。

5. 特殊情况考虑：

   • 如果公司法人独资的情况涉及到了公司法或相关企业法规的特殊规定（如一人有限责任公司的限制等），则需要进一步结合这些法规进行分析。但一般来说，只要满足合伙的基本条件，并且有相关证据能够证明合伙关系的存在，那么这种合伙关系在法律上就是有效的。

综上所述，公司法人独资合伙人之间即使没有书面协议，只要满足合伙的基本条件并且有相关证据能够证明合伙关系的存在，那么这种合伙关系在法律上就是有效的。但为了避免日后产生纠纷，建议合伙人之间最好签订完善的书面合伙协议。如果您有任何关于公司法务、股权转让等方面的法律问题，欢迎直接向我咨询。