针对您提出的“对在以渔业为主的渔港水域内违反港航法律法规造成水上交通事故的行政处罚”问题，以下是我的详细解答：
一、行政处罚的法律依据
根据《中华人民共和国渔业港航监督行政处罚规定》第三十一条，对于在以渔业为主的渔港水域内违反港航法律法规造成水上交通事故的，对船长或直接责任人将按照以下规定进行处罚：
- 造成特大事故的：处以3000元以上5000元以下罚款，并吊销职务船员证书。
- 造成重大事故的：予以警告，并处以1000元以上3000元以下罚款，同时扣留其职务船员证书3至6个月。
- 造成一般事故的：予以警告，并处以100元以上1000元以下罚款，同时扣留职务船员证书1至3个月。
此外，如果事故发生后，相关人员不向渔政渔港监督管理机关报告、拒绝接受调查或在接受调查时故意隐瞒事实、提供虚假证词或证明的，将从重处罚。
二、行政处罚的程序
行政处罚的程序通常包括以下几个步骤：
- 立案责任：渔业行政处罚机关在发现涉嫌违法行为后，将进行初步调查，并决定是否立案。
- 调查取证责任：立案后，将指定专人负责调查取证，收集相关证据，并制作笔录。
- 审理责任：行政处罚机关负责人将对案件进行审查，提出处理意见。对于案情复杂或有重大违法行为的案件，将由海洋渔业行政处罚机关负责人集体讨论决定。
- 告知责任：在作出行政处罚决定前，将制作《行政处罚事先告知书》送达当事人，告知其违法事实及享有的陈述、申辩等权利。
- 决定责任：行政处罚机关在审查当事人的陈述、申辩或听证情况后，将作出行政处罚决定，并制作行政处罚决定书。
- 送达责任：行政处罚决定书将在宣告后当场交付当事人，或按照民事诉讼法的有关规定送达当事人。
- 执行责任：当事人应自觉履行行政处罚决定，如逾期不履行，行政机关将依法采取强制执行措施。
三、法律建议
- 遵守法律法规：在渔港水域内航行或作业时，务必严格遵守港航法律法规，确保航行安全。
- 及时报告事故：如发生水上交通事故，应立即向渔政渔港监督管理机关报告，并配合调查。
- 积极配合调查：在接受调查时，应如实陈述事实，提供真实证据，不得隐瞒或提供虚假证词。
如有任何关于交通运输（事故责任）或司法行政方面的法律问题，欢迎直接向我咨询。我将运用我的专业知识和经验，为您提供全面、准确的法律解答。