针对您提出的“关联公司法人是同一个，签了劳务合同怎么认定劳动关系”的问题，这确实是一个涉及劳动法复杂情况的案例。下面，我将从法律角度和实际操作层面，为您详细解析如何认定劳动关系。

一、法律原则与认定标准

在劳动法中，劳动关系的认定主要基于以下几个核心要素：

1. 主体资格：劳动者和用人单位均需具备相应的法律主体资格。
2. 从属关系：劳动者需接受用人单位的管理、指挥和监督，双方存在从属关系。
3. 工作内容：劳动者提供的工作是用人单位业务的组成部分。
4. 报酬支付：用人单位需向劳动者支付劳动报酬。

二、关联公司混同用工的特殊情况

在关联公司混同用工的情况下，劳动关系的认定可能更为复杂。特别是当两家关联公司的法定代表人为同一人，且劳动者与其中一家公司签订了劳务合同（或劳动合同）后，又被指派到另一家公司工作时，劳动关系的认定需综合考虑以下因素：

1. 合同签订情况：首先，需查看劳动者与哪家公司签订了正式的劳务合同或劳动合同。这是认定劳动关系的重要依据。
2. 工作安排与管理：其次，需考察劳动者在实际工作中是由哪家公司进行工作安排、管理和监督。如果劳动者虽然被指派到另一家公司工作，但工作安排、管理和监督仍由原合同签订公司负责，那么劳动关系可能仍归属于原合同签订公司。
3. 报酬支付与社会保险：还需关注劳动者的劳动报酬和社会保险是由哪家公司支付和缴纳的。这也是认定劳动关系的重要参考因素。

三、具体案例分析

以您提到的案例为例，刘某与甲公司签订了劳动合同，并被指派到乙公司工作。然而，刘某的劳动报酬和社会保险仍由甲公司负责。在这种情况下，法院经审理认为，刘某与甲公司之间存在劳动关系，而与乙公司之间并无劳动关系。因为刘某的行为（如向甲公司提出解除劳动关系申请）表明其选择确认了与甲公司的劳动关系。

四、建议与操作指南

1. 明确合同关系：劳动者在签订劳务合同或劳动合同时，应明确合同双方主体，避免因关联公司混同用工而产生纠纷。
2. 保留证据：劳动者在工作过程中，应保留好与工作安排、管理、监督以及报酬支付、社会保险缴纳等相关的证据，以便在发生纠纷时能够证明自己的劳动关系归属。
3. 及时咨询：如果劳动者对劳动关系的认定存在疑问或纠纷，应及时咨询专业律师或劳动仲裁机构，以获取准确的法律意见和帮助。

综上所述，关联公司混同用工情况下劳动关系的认定需综合考虑多个因素。劳动者应明确自己的合同关系，保留好相关证据，并在必要时及时咨询专业律师或劳动仲裁机构以维护自己的合法权益。