关于起诉赔付代替交通费的费用由谁来承担的问题，这主要取决于案件的具体情况以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度进行的详细分析：

1. 交通事故责任纠纷中的替代性交通工具费用

   • 在交通事故责任纠纷中，如果非经营性车辆因事故无法继续使用，所产生的通常替代性交通工具的合理费用，应当由侵权人赔偿。这是根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条的规定。
   • 例如，在江西省芦溪县人民法院审结的一起案件中，陈某的车辆因交通事故被送修，期间他通过乘坐出租车方式产生打车费用，法院最终判决侵权人吴某赔偿该费用。
   • 替代性交通工具的合理费用应依据权利人日常且合理的出行需求、车辆用途等判断，对于替代性交通费的金额应当参照本地生活水平、消费水平的实际情况。权利人若需主张车辆维修期间的替代性交通工具损失，应当保留好维修清单、发票、租赁合同以及必要出行证明等相关材料，对其主张的替代性交通费予以证明。

2. 诉讼期间交通费的承担原则

   • 在民事诉讼中，通常遵循“谁主张，谁先行垫付”的原则，即主张权益的一方需先行垫付参与诉讼的必要交通费。然而，若诉讼请求获得法院支持，合理的交通费用往往由败诉方承担，作为损失的一部分。
   • 需要注意的是，诉讼期间的交通费与交通事故责任纠纷中的替代性交通工具费用是两个不同的概念。诉讼期间的交通费是指因参与诉讼而产生的费用，而替代性交通工具费用是指因车辆无法使用而产生的费用。

3. 特殊情况下的费用承担

   • 在某些特殊情况下，如双方在合同中已明确约定诉讼期间交通费等费用的承担方式，且不违反法律法规的强制性规定，则按合同约定执行。
   • 另外，如果案件情况复杂，双方均有过错，法院可能会根据责任比例判定双方分担诉讼期间的交通费。

4. 法律建议

   • 对于因交通事故或其他原因导致车辆无法使用而产生的替代性交通工具费用，权利人应当保留好相关证据，如维修清单、发票、租赁合同以及必要出行证明等，以便在主张权利时提供充分的证据支持。
   • 在诉讼过程中，如果涉及交通费的承担问题，建议权利人咨询专业律师，以便更好地了解自己的权益和可能的法律后果。

综上所述，起诉赔付代替交通费的费用由谁来承担，主要取决于案件的具体情况以及相关法律法规的规定。在大多数情况下，如果替代性交通工具费用是合理的且与案件相关，那么该费用应当由侵权人或败诉方承担。然而，在具体案件中，还需要根据法院的判断和相关证据来确定费用的承担方。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。