关于离职协议签完后有事实劳动关系是否有效的问题，结论前置如下：

1. 一般情况下，离职协议签完后，原劳动合同失效，若存在事实劳动关系，其有效性需根据具体情况判断。

接下来，我将从不同角度详细分析这一问题：

一、离职协议与劳动合同的关系

• 离职协议是员工和用人单位就解除劳动关系相关事宜达成的约定。按照《中华人民共和国劳动合同法》，劳动合同的解除有多种情形，协商解除便是其中之一。当员工与用人单位签订离职协议，就代表双方协商一致解除了劳动关系。此时，原劳动合同中约定的双方权利义务通常终止，合同自然失去效力。

二、事实劳动关系与离职协议的关系

• 事实劳动关系是指用人单位与劳动者之间没有签订书面劳动合同，但双方实际履行了劳动权利义务而形成的劳动关系。若离职协议签完后，双方仍存在事实劳动关系，这可能是由于离职协议未完全履行、存在误解或欺诈等原因导致的。

• 在这种情况下，事实劳动关系的有效性需根据具体情况判断。如果离职协议存在无效情形（如违反法律法规强制性规定、存在欺诈胁迫等），则离职协议可能不被认可，进而影响事实劳动关系的认定。但若离职协议合法有效，且双方已实际履行了离职协议中的约定，则事实劳动关系可能不被认可。

三、法律建议与可能后果

• 对于员工而言，若在离职协议签完后发现仍存在事实劳动关系，应首先与用人单位沟通协商，明确双方的权利义务关系。若协商无果，可考虑向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

• 对于用人单位而言，应确保离职协议的合法性和有效性，避免因离职协议存在瑕疵而导致事实劳动关系的认定。同时，用人单位在解除劳动关系时，应严格按照法律法规和程序规定办理相关手续，确保双方权益得到充分保障。

四、特殊情况分析

• 在某些特殊情况下，如劳动者离职后被原单位返聘，双方重新达成新的用工合意并签订新的合同，此时即使存在事实劳动关系，也应以新签订的合同为准。因为新合同代表了双方最新的权利义务关系，且符合法律法规的规定。

综上所述，离职协议签完后有事实劳动关系是否有效，需根据具体情况判断。若您在离职过程中遇到相关问题或争议，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议和解决方案。