关于交通事故中出租车营运损失的赔偿问题，这是一个涉及多方面因素的复杂议题。下面，我将从赔偿责任主体、赔偿范围与计算方式、赔偿流程以及注意事项几个方面，为您进行详细解答。

一、赔偿责任主体

1. 对方全责： 如果事故责任完全在对方，那么出租车的停运损失应由对方承担。这包括直接肇事者或其保险公司（如果车辆已投保）。在您提到的案例中，赵先生因负全部责任，被法院判决赔偿余先生的停运损失。

2. 双方或多方责任： 如果事故责任不完全在对方，而是双方或多方共同造成的，那么停运损失的赔偿责任将根据各方的过错比例进行分担。

3. 单方责任： 如果是出租车司机自己的责任导致的事故，那么停运损失通常需要由出租车司机自行承担，除非其购买了相应的保险覆盖此类损失。

二、赔偿范围与计算方式

1. 赔偿范围： 停运损失主要包括出租车因无法正常营运而减少的收入，以及可能产生的其他相关费用（如司机工资、税费等，但具体是否包含需根据法律规定和保险合同条款确定）。在您提到的案例中，余先生的停运损失就包括了车辆承包金及误工费。

2. 计算方式：

   • 日收入标准：通常以出租车司机近期的平均日收入为基准进行计算。这需要提供相关的收入证明，如银行流水、税务记录或出租车公司的收入证明等。
   • 停运天数：根据实际维修时间或合理预计的维修时间来确定。如果出租车因事故导致报废或需要长时间维修，停运天数可能会相应延长。在您提到的案例中，法院根据合理的修车时间、因维修费支付而产生的沟通时间、双方当事人的过错情形酌定了车辆合理停运时间。
   • 计算公式：停运损失 = 日收入标准 × 停运天数。

三、赔偿流程

1. 收集证据： 出租车司机应尽快收集与事故和停运损失相关的所有证据，包括事故认定书、维修记录、收入证明等。这些证据将在后续的协商或诉讼中起到关键作用。

2. 协商赔偿： 首先尝试与对方或其保险公司进行协商，看是否能够就停运损失的赔偿达成一致意见。在协商过程中，出租车司机应明确提出自己的赔偿要求，并提供相应的证据支持。

3. 法律途径： 如果协商无果，出租车司机可以向人民法院提起诉讼，要求对方赔偿停运损失。在诉讼过程中，法院将根据双方提供的证据和法律规定来判定赔偿责任和金额。

四、注意事项

1. 及时报案： 事故发生后应及时向交警部门报案并获取事故认定书，这是后续索赔的重要依据。

2. 保留证据： 务必妥善保管好所有与事故和停运损失相关的证据材料，包括但不限于事故认定书、维修记录、收入证明、沟通记录等。这些证据将在后续的协商或诉讼中起到关键作用。

3. 了解保险条款： 出租车司机应了解自己的保险合同条款，看是否有关于停运损失的特别约定或免责条款。如果保险合同中包含了停运损失的赔偿条款，那么出租车司机在索赔时应充分利用这一条款来维护自己的权益。

综上所述，交通事故中出租车营运损失的赔偿问题涉及多个方面，需要出租车司机在事故发生后及时采取措施，收集证据，并与对方或其保险公司进行协商或诉讼来维护自己的权益。