承包合同无效时，登记机关在一定条件下可以主动纠错，具体情况分析如下：

1. 涉及不动产登记且合同无效的情况：

   • 当事人可主动向登记部门申请更正登记，也可凭借生效法律文书促使登记部门启动更正登记程序，让登记恢复到原来的状态。
   • 根据《中华人民共和国民法典》第二百二十条规定，权利人、利害关系人认为不动产登记簿记载的事项错误的，可以申请更正登记。不动产登记簿记载的权利人书面同意更正或者有证据证明登记确有错误的，登记机构应当予以更正。因此，若承包合同涉及不动产且被判定为无效，登记机关在收到相关申请或生效法律文书后，应启动更正登记程序，撤销基于无效合同进行的登记，恢复登记原状。

2. 企业登记中因合同无效出现登记错误的情况：

   • 企业应按登记部门要求提供相关证明材料，配合进行登记事项的变更或撤销。
   • 若当事人不配合，登记部门会依职权直接撤销登记。这意味着，在企业登记方面，当因无效合同导致登记错误时，登记机关有权要求企业提供证明材料进行变更登记，若企业不配合，登记机关可依职权直接作出撤销登记决定。

3. 登记部门收到法院协助执行通知的情况：

   • 当因合同无效引发争议，且登记部门收到法院协助执行通知时，会依法协助完成相关登记的变更、撤销等操作。这表明，在合同无效争议经法院判决后，若法院向登记部门发出协助执行通知，登记机关需依法协助执行，完成相关登记的变更、撤销等操作。

综上所述，承包合同无效时，登记机关在涉及不动产登记、企业登记错误以及收到法院协助执行通知等情况下，可以主动纠错。但具体纠错程序和方式可能因地区和登记机关的不同而有所差异，建议在实际操作中咨询当地登记机关或专业律师以获取准确信息。如有任何关于合同纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。