关于“总包和甲方官司是否按照备案合同来”的问题，我可以从以下几个方面为你详细解答：

核心结论：在处理总包和甲方之间的官司时，是否按照备案合同来，取决于具体的法律规定和案件事实。一般情况下，备案合同具有一定的法律效力，但并非绝对，还需考虑其他因素。

一、备案合同的法律效力

1. 一般情况：备案合同通常是在相关部门进行备案的，具有一定的公示性和公信力。在合同纠纷中，备案合同往往被视为双方真实意思的表示，具有相应的法律效力。

2. 特殊情况：然而，并非所有备案合同都必然具有法律效力。如果备案合同存在违法内容、违反公序良俗或双方意思表示不真实等情况，那么该合同可能被认定为无效或部分无效。

二、司法实践中的考量

1. 合同内容与实际履行：在司法实践中，法院会综合考虑合同的具体内容以及双方的实际履行情况。如果备案合同与实际履行情况存在不一致，法院可能会根据实际履行情况来认定合同关系。

2. 其他证据：除了备案合同外，法院还会考虑其他相关证据，如双方往来邮件、聊天记录、付款凭证等，以全面了解案件事实并作出公正裁决。

三、相关法律依据

• 《中华人民共和国民法典》等相关法律法规对合同的效力、履行以及纠纷处理等方面进行了详细规定。在处理总包和甲方官司时，应依据相关法律法规进行综合判断。

四、建议与总结

1. 建议：在处理总包和甲方之间的合同纠纷时，建议双方首先查阅备案合同的具体内容，并结合实际履行情况和其他相关证据来综合判断合同关系。如果无法达成一致意见，可以寻求专业律师的帮助进行法律分析和诉讼代理。

2. 总结：总之，是否按照备案合同来处理总包和甲方之间的官司，需要综合考虑多种因素。备案合同虽然具有一定的法律效力，但并非绝对。在处理纠纷时，应依据相关法律法规和案件事实进行综合判断。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。