两家公司股票因关联交易披露不当而被立案，可能会构成以下严重后果：
行政处罚：根据《中华人民共和国证券法》的相关规定，如果公司未按照规定披露关联交易，或者披露的信息存在虚假记载、误导性陈述或者重大遗漏，证监会或其派出机构可以对公司及相关责任人员采取责令改正、监管谈话、出具警示函、责令公开说明、认定为不适当人选、责令停止相关业务、暂不受理与行政许可有关的文件等监管措施；情节严重的，还可以处以罚款、警告等行政处罚。
市场声誉受损：关联交易披露不当被立案调查，往往会引起市场的广泛关注，对公司的市场声誉造成负面影响。这可能会导致投资者对公司失去信心，进而影响公司的股价和市场表现。
投资者索赔：如果因关联交易披露不当导致投资者权益受损，投资者可能会通过法律途径向公司及相关责任人员提起索赔诉讼。公司可能需要承担巨额的赔偿责任，这不仅会损害公司的财务状况，还可能影响公司的正常运营。
影响公司上市进程或再融资：对于正在寻求上市或再融资的公司而言，关联交易披露不当被立案调查可能会对其上市进程或再融资计划产生不利影响。证监会可能会对公司的上市申请或再融资申请提出更严格的审查要求，甚至可能暂停或终止公司的上市进程或再融资计划。
内部管理风险：关联交易披露不当还可能暴露出公司内部管理存在的问题，如内部控制不完善、信息披露制度不健全等。这可能会导致公司面临更大的内部管理风险，需要公司加强内部管理，完善信息披露制度，以避免类似问题再次发生。
综上所述，两家公司股票因关联交易披露不当而被立案，可能会面临行政处罚、市场声誉受损、投资者索赔、影响公司上市进程或再融资以及内部管理风险等多重严重后果。因此，公司应严格遵守相关法律法规，确保关联交易的合规性和信息披露的准确性。