单位犯罪一般不可以多次分批起诉多个被告人。在单位犯罪案件中，通常会将所有涉及的被告人一起起诉，以确保案件的完整性和公正性。这是因为单位犯罪往往涉及多个被告人的共同行为，他们之间的责任和义务是相互关联的，需要在一个统一的诉讼程序中进行审理和判决。

具体来说，根据刑事诉讼法的相关规定，对于单位犯罪案件，检察机关会依法对涉案的单位和被告人进行审查起诉。在审查起诉过程中，检察机关会综合考虑案件的事实、证据以及被告人的犯罪情节、社会危害程度等因素，依法作出起诉决定。而一旦检察机关决定起诉，通常会将所有涉及的被告人一起提起公诉，由法院进行统一审理。

当然，在某些特殊情况下，如被告人人数众多、案情复杂等，法院可能会根据具体情况决定分批审理。但这种情况下，分批审理也是基于案件的整体性和公正性考虑，而不是随意将被告人分批起诉。

总之，单位犯罪一般不可以多次分批起诉多个被告人，以确保案件的完整性和公正性。如果面临相关问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。