拆迁后分配的房产协议书原件丢失，只有复印件的情况下，通常可以尝试办理房产证，但具体能否办理成功需结合当地房产管理部门的规定和要求。
首先，拆迁协议是办理房产证的重要证明材料之一。若原件丢失，您可以尝试以下措施来补办或替代：
向拆迁部门或相关单位申请复印留存的拆迁协议副本，并请其加盖公章以证明其与原件具有同等效力。这是最直接且有效的方式，因为拆迁部门或相关单位通常会留存拆迁协议的档案。
提供其他能够证明拆迁事实的辅助材料，如拆迁补偿款的领取记录、相关的通知文件等。这些材料虽然不能完全替代拆迁协议原件，但可以在一定程度上证明拆迁事实的存在。
接下来，您需携带上述材料前往当地房产管理部门进行咨询和申请。在申请过程中，务必详细说明情况，并按照房产管理部门的要求进行操作。
需要注意的是，不同地区的房产管理部门对于拆迁协议原件丢失的处理方式可能存在差异。因此，在办理前最好先咨询当地房产管理部门的具体要求，以免因材料不全或不符合要求而耽误办理进程。
综上所述，虽然拆迁协议原件丢失可能会对办理房产证造成一定影响，但并非绝对不能办理。通过采取上述措施，并积极配合房产管理部门的要求，您仍有可能成功办理房产证。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。