当原告发现所认定的被告身份错误时，应及时采取措施进行更正，以确保诉讼的顺利进行和自身权益的保障。以下是对此问题的详细解答：
一、原告发现被告身份错误的处理方式
及时提交变更申请：
- 原告应在法庭辩论结束前，向法院递交书面的变更被告申请。
- 申请中应详细阐述错误缘由以及正确的被告相关信息，如姓名、住址、联系方式等。
法院审查与裁定：
- 法院将对原告的变更申请进行审查，核实错误原因及新被告信息的准确性。
- 若申请符合法律要求，法院将裁定准许变更被告。
诉讼程序的继续：
- 变更被告后，已进行的诉讼程序对新被告依然有效。
- 若变更导致案件性质、管辖等发生变化，法院将依据具体情形作出相应处置。
费用承担：
- 因变更被告而产生的公告费等相关费用，通常由原告承担。
二、注意事项
准确确定被告：
- 在起诉前，原告应尽可能准确地确定被告身份，避免因错误告诉而导致的诉讼延误和成本增加。
及时沟通：
- 若在诉讼过程中发现被告身份错误，原告应及时与法院沟通，了解变更被告的具体流程和要求。
保留证据：
- 原告应保留与案件相关的所有证据，以便在变更被告后能够迅速重新组织诉讼材料。
三、被告的应对措施
若被告发现原告所诉主体错误，也可采取以下措施维护自身权益：
提交管辖权异议或答辩意见：
- 在答辩期内，被告可提交管辖权异议或直接提出原告主体不适格的答辩意见。
积极举证：
- 在庭审过程中，被告应积极举证，阐明原告不符合主体资格的事实和理由。
等待法院裁定：
- 若法院认定原告主体错误，可能会裁定驳回起诉。被告应配合法院后续的程序，若原告不服裁定上诉，被告需继续参与二审程序维护自身权益。
综上所述，当原告发现所认定的被告身份错误时，应及时向法院提交变更申请，并承担因变更而产生的相关费用。同时，被告在发现原告主体错误时，也应采取相应措施维护自身权益。在整个过程中，保持与法院的及时沟通、准确确定被告身份以及保留相关证据都是至关重要的。