协议并非必须一式两份且上面均有双方签名才有效。下面为你详细分析：

1. 协议生效的关键要素：
   • 协议内容需符合法律规定。
   • 双方当事人要有相应的民事行为能力。
   • 意思表示必须真实。
   • 不能违反法律、行政法规的强制性规定。

满足这些条件，协议即为有效。一式两份并非协议生效的必要条件。

1. 一式两份的作用：

   • 一式两份主要是方便双方各自留存，以便更好地履行协议。
   • 若协议明确约定需一式两份且双方均已签字盖章，未按此执行可能会对协议的履行产生影响，并在发生争议时，其作为证据的效力也可能受到削弱。

2. 特殊情况：

   • 某些特定情形下，法律会对协议的形式或份数作出要求，比如不动产交易相关协议等。

综上所述，判断协议是否有效，要依据具体法律规定和协议内容，不能一概而论。即使协议只有一份，只要满足上述生效的关键要素，它仍然是有效的。在签订协议时，双方应当认真阅读并明确各自的权利义务，以确保协议的法律效力得到有效体现。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。