针对“体育课学生跑步骨折，校方责任险是否理赔”的问题，我们可以结合您提供的参考信息来详细分析。
首先，我们需要明确几个关键点：
- 事故背景：学生在体育课上跑步时发生骨折。
- 保险类型：学校购买了“校方责任险”。
- 法律责任：学校作为教育机构，对在校生具有教育、管理和保护的责任。
接下来，我们根据这些关键点进行推理分析：
学校责任判断：
- 学生在校期间进行体育活动受伤，学校是否需要承担责任，关键在于学校是否尽到了教育、管理和保护的责任。
- 参考信息中的案例表明，由于学校没有安排专业的体育老师进行授课，也没有安排好学生在操场专用跑道内进行有序的跑步活动，导致学生跑步时秩序较为混乱，从而发生碰撞受伤。这种情况下，学校存在管理上的疏漏，与学生的受伤存在法律上的因果关系。
校方责任险的作用：
- 校方责任险是学校为了转移自身风险而购买的一种保险。当学校因其过错导致学生受伤并需要承担赔偿责任时，保险公司将代替学校进行赔偿。
- 在您提供的案例中，由于学校存在管理上的疏漏，需要承担主要责任，因此保险公司根据保险合同进行了赔偿。
理赔判断：
- 结合上述分析，如果学生在体育课上跑步骨折是由于学校的管理疏漏或未尽到教育、管理职责导致的，那么学校应当承担侵权责任。
- 既然学校需要承担责任，并且已经购买了校方责任险，那么保险公司就应当按照保险合同的约定进行理赔。
综上所述，如果学生在体育课上跑步骨折是由于学校的管理疏漏或未尽到教育、管理职责导致的，那么校方责任险是应当进行理赔的。但具体理赔金额和比例会根据保险合同的约定以及实际情况来确定。因此，在实际操作中，建议受伤学生及其家长及时与学校、保险公司沟通协商，并依据相关法律法规和保险合同条款来维护自己的合法权益。