针对您提出的问题“村委会和村民签订征收协议，村民已领取补偿款，合同是否有效”，以下是我的详细分析：
结论：村委会与村民签订的征收协议是否有效，需根据具体情况判断，主要依赖于协议签订的主体资格、程序合法性、内容合法性以及是否存在违法情形。
分析说明：
主体资格与委托关系：
- 若村委会是依法接受市县级以上人民政府的委托，与村民签订补偿协议，并且没有其他违法事由，则该协议可认定为合法有效。
- 若村委会未经合法委托，以自己的名义组织实施征收，并与村民签订补偿协议，则该协议属于无效合同，因为村委会没有征收的主体资格。
程序合法性：
- 补偿协议的签订应遵循一定的程序，如召开村民大会或村民代表大会进行讨论表决、公示公告等，以确保村民的知情权和参与权。若程序存在瑕疵，可能影响协议的效力。
内容合法性：
- 协议内容应明确、具体，包括补偿标准、方式、时间等关键条款，且不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背社会公德和公共秩序。
- 补偿标准应合理合法，符合当地政策规定和市场行情。若补偿标准过低或存在其他不公平条款，村民有权请求撤销或认定协议无效。
是否存在违法情形：
- 如存在无权处分、恶意串通、显失公平等情形，均可能影响协议的效力。
已领取补偿款的影响：
- 村民已领取补偿款的事实，并不直接决定协议的效力。即使村民已领取补偿款，若协议存在上述违法情形，仍可能被认定为无效。
法律建议：
- 在签订征收协议前，村民应仔细审查协议内容，确保协议主体合法、程序合规、内容合理，并保留好相关证据。
- 若对协议效力存在疑问，或遭遇拆迁纠纷，建议及时咨询专业律师，以维护自身合法权益。
综上所述，村委会与村民签订的征收协议是否有效，需综合考虑多个因素。若您对此类问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。