结论前置：浦发信用卡逾期后，新办的储蓄卡存入100元是否会被扣除，主要取决于银行的具体操作规定以及信用卡逾期的具体情况。一般来说，储蓄卡与信用卡虽然同属一家银行，但两者的账户是独立的，储蓄卡中的资金通常不会被直接用于抵扣信用卡的欠款，除非银行有明确的约定或法院的执行裁定。

详细分析：

1. 账户独立性：储蓄卡和信用卡在银行内部是分别管理的两个独立账户。储蓄卡主要用于存款和取款，而信用卡则用于透支消费。因此，从账户管理的角度来看，储蓄卡中的资金不会被自动用于偿还信用卡的欠款。

2. 银行规定：虽然账户独立，但部分银行可能会在信用卡逾期后，对持卡人在该银行的其他账户（包括储蓄卡）采取一定的限制措施，如冻结账户、划扣资金等。然而，这些措施通常需要银行事先与持卡人达成相关协议，或者在信用卡领用合约中有明确约定。如果银行没有相关约定或协议，就不能随意划扣储蓄卡中的资金。

3. 法律执行：在信用卡逾期严重，且银行已经通过法律途径追讨欠款的情况下，如果法院作出执行裁定，允许银行划扣持卡人在该银行或其他银行的账户资金以偿还欠款，那么储蓄卡中的资金就可能会被扣除。但这种情况需要银行先通过法律程序取得执行裁定。

4. 实际操作：在实际操作中，银行通常会先通过电话、短信、邮件等方式催促持卡人还款，而不会直接划扣储蓄卡中的资金。如果持卡人长时间不还款，银行可能会采取更进一步的法律措施。

建议：

• 如果你担心储蓄卡中的资金会被扣除，建议主动联系浦发银行客服，了解银行的具体规定和操作流程。
• 如果信用卡已经逾期，应尽快与银行协商还款事宜，避免产生更多的利息和滞纳金。
• 在使用信用卡时，应合理规划消费，确保能够按时还款，避免逾期带来的不良影响。