关于停工期间哪些费用由甲方承担的问题，这主要取决于停工的原因、合同的具体条款以及相关的法律法规。以下是根据不同情况的分析：

1. 因不可抗力导致的停工：

   • 根据《工程量清单计价规范》第9.10.1条，因不可抗力事件导致的人员伤亡、财产损失及其费用增加，发承包双方应按一定原则分担。具体来说，承包人的施工机械设备损坏及停工损失，应由承包人承担；而停工期间，承包人应发包人要求留在施工场地的必要的管理人员及保卫人员的费用，则应由发包人承担。
   • 在《施工合同（示范文本）》中，也有类似的规定，即因不可抗力影响承包人履行合同约定的义务，已经引起或将引起工期延误的，停工期间必须支付的工人工资由发包人承担。

2. 因发包人未支付工程进度款导致的停工：

   • 若发包人未能支付全部工程进度款导致承包人停工，根据最高人民法院的相关裁判规则和典型案例，停工损失原则上应由发包人承担。这包括机械停滞费、人工工资等窝工损失。

3. 其他情况下的停工：

   • 对于其他非因不可抗力或发包人未支付工程进度款导致的停工，费用承担问题应根据合同的具体条款来确定。如果合同中有明确约定，则按合同约定执行；如果合同中没有约定或约定不明，则需要双方协商解决或依据相关法律法规进行裁决。

综上所述，停工期间哪些费用由甲方承担，需要根据停工的具体原因、合同的具体条款以及相关的法律法规来综合判断。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。