在工程甲乙双方合作中，交房不经过乙方盖章通常是不合法的。下面我将从几个方面详细解释这一结论：

1. 合同约定与双方权利：

   • 在建设工程合同中，甲乙双方通常会明确约定各自的权利和义务，包括工程的交付、验收、盖章等流程。
   • 如果合同中明确规定了交房需要乙方盖章，那么不经过乙方盖章就交房，就违反了合同的约定，属于违约行为。

2. 法律效力与合规性：

   • 根据相关法律法规，合同的签订和履行应当遵循诚实信用原则，并按照合同约定的条款执行。
   • 不经过乙方盖章就交房，可能导致合同无效或部分无效，进而引发法律纠纷。
   • 此外，这种行为还可能违反建筑、房地产等领域的法律法规，如《建筑法》、《房地产管理法》等。

3. 实际操作与风险：

   • 在实际操作中，不经过乙方盖章就交房可能会给双方带来潜在的风险。
   • 对于甲方而言，可能面临乙方追究违约责任的风险；对于乙方而言，可能无法确保自己的合法权益得到充分保障。

4. 建议与解决方案：

   • 如果确实存在交房不经过乙方盖章的情况，建议双方尽快沟通并协商解决方案。
   • 可以考虑补充签订协议或备忘录，明确双方的权利和义务，以及交房的具体流程和条件。
   • 如果无法达成一致，建议寻求专业法律帮助，通过法律途径解决纠纷。

综上所述，交房不经过乙方盖章通常是不合法的，因为它违反了合同的约定和法律法规的规定。建议双方在处理此类问题时，务必遵循诚实信用原则，并按照合同约定的条款执行。如果你有任何进一步的法律问题或需要更详细的解答，请直接向我咨询。