实习三方协议在一般情况下是需要归入档案的。以下是对此问题的详细解答：

一、三方协议的基本概念

三方协议，全称《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，是由学校、用人单位、毕业生三方共同签订的，用于明确三方在就业择业过程中的权利和义务关系的书面协议。这份协议对签约的三方均具有约束力，并主要解决毕业生的档案、户口迁移等就业手续问题。

二、三方协议与档案的关系

1. 档案转递的依据：三方协议是学校派遣毕业生的依据。在学生毕业离校前，学校将根据协议书的内容开具毕业生就业报到证和户口迁移证，并同时转递学生档案。因此，三方协议是档案转递的重要依据。

2. 干部身份的获取：只有签署了三方协议并拿回学校，学校才会在毕业后将派遣证发给学生。学生拿着派遣证到工作的单位报到，就此开始计算工龄，并拥有了干部身份。这也说明了三方协议与档案、工龄计算及干部身份获取之间的紧密联系。

3. 就业意向的凭证：虽然三方协议只是毕业生、用人单位、学校三方之间签订的就业意向，并不是劳动关系的法律文件，但它仍然是毕业生就业过程中的重要凭证。在毕业生到单位报到、用人单位正式接收后，三方协议自行终止，但其在此过程中的作用不可忽视。

三、实习三方协议的归档

由于三方协议在毕业生就业过程中具有如此重要的作用，且是档案转递和干部身份获取的依据，因此，在一般情况下，实习三方协议是需要归入档案的。这不仅有助于记录毕业生的就业历程，也是后续办理相关手续（如职称评定、社保缴纳等）的重要依据。

四、注意事项

1. 妥善保管：毕业生应妥善保管好自己的三方协议，避免遗失或损坏。

2. 及时办理手续：在签订三方协议后，毕业生应及时到学校办理相关手续，如派遣证、户口迁移等。

3. 了解协议内容：在签订三方协议前，毕业生应认真阅读协议内容，了解各方的权利和义务，确保自己的权益得到保障。

综上所述，实习三方协议在一般情况下是需要归入档案的，这是毕业生就业过程中的重要环节，也是后续办理相关手续的重要依据。因此，毕业生应妥善保管好自己的三方协议，并及时办理相关手续。