关于三方协议是否要入档案的问题，这个并不是绝对的，而是需要根据具体情况来确定。

首先，我们要明确三方协议的基本概念。三方协议，也就是《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，它是明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式。这份协议在毕业生就业过程中起着非常重要的作用，可以看作是毕业生与用人单位建立劳动关系的初步证明。

一般来说，三方协议并不会直接存入个人的人事档案。人事档案主要记录的是个人的学习、工作经历以及相关的政治面貌、品德作风等基本情况，它反映的是个人的成长历程和综合素质。而三方协议则更多的是一种具有法律效力的合同文本，用于明确各方在就业过程中的权利义务关系。因此，在常规的人事档案管理中，三方协议通常不会被直接放入档案中。

然而，也存在一些特殊情况。比如，某些地区或学校的档案管理规定可能有所不同，为了更全面地记录毕业生的就业情况，他们可能会将三方协议作为毕业生就业材料的一部分存入档案。另外，也有可能在档案管理过程中出现工作疏忽或管理不善的情况，导致原本不应存入档案的三方协议被错误地归档。

因此，对于毕业生来说，了解当地或学校的档案管理规定是非常重要的。如果你担心自己的档案中是否包含了三方协议，建议你可以咨询当地的档案管理机构或相关部门以获取准确的信息。同时，无论三方协议是否存入档案，你都应该妥善保管好这份重要的合同文本，以备不时之需。

总的来说，三方协议是否要入档案取决于具体的档案管理规定和实践操作。在大多数情况下，它并不会直接存入档案，但也存在一些特殊情况。所以，最好的做法还是了解清楚当地或学校的档案管理规定，并妥善保管好自己的三方协议。