针对您提出的“工程款长时间未结算怎么维护自己合法权益”的问题，以下是一些具体的建议和步骤，希望能帮助您更好地维护自己的权益：

一、保留证据，确保资料完整

首先，您需要妥善保存与工程相关的所有资料，这些资料将作为您维权的关键证据。包括但不限于：

• 施工合同：这是双方权利义务的基础，也是维权的重要依据。
• 工程进度报告、施工记录：这些记录了工程的实际进展和施工过程，有助于证明您已完成的工作。
• 验收文件：如果工程已经验收，那么验收文件将证明工程的质量和完成情况。
• 往来函件、结算单：与对方的沟通记录和结算请求，能够证明您已积极寻求解决问题。

二、友好协商，明确结算期限和方式

在保留好证据的基础上，您可以尝试与对方进行友好协商。通过书面或口头的形式，明确结算的期限和方式，并留存好协商的记录。如果对方同意结算，但拖延时间或提出不合理的条件，您可以考虑通过法律途径来维权。

三、向相关部门投诉或申请调解

如果协商无果，您可以向工程所在地的建设行政主管部门投诉，请求他们介入调解或督促对方结算。此外，您还可以向相关行业协会或第三方调解机构提出调解申请，借助专业人员的力量来达成和解协议。

四、依据合同条款选择仲裁或诉讼

如果投诉和调解均未能解决问题，您可以根据合同中的争议解决条款来选择仲裁或诉讼。

• 仲裁：如果合同中约定了仲裁条款，您可以向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁裁决具有法律效力，如果对方不履行，您可以向法院申请强制执行。
• 诉讼：如果合同中没有仲裁条款或仲裁条款无效，您可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要明确自己的诉讼请求（如要求对方支付工程款、逾期付款利息等），并提供充足的证据来支持您的主张。

五、注意诉讼时效和程序规定

在维权过程中，您还需要注意诉讼时效和程序规定。一般来说，诉讼时效为三年，从您知道或应当知道自己的权利被侵害之日起计算。因此，您需要尽快采取行动来维护自己的权益。同时，在诉讼或仲裁过程中，您需要遵守相关的程序规定，如提交证据、出庭应诉等。

六、寻求专业法律帮助

如果您在维权过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业的法律帮助。咨询律师或法律专家，了解具体的法律程序和维权策略，将有助于您更好地维护自己的权益。

综上所述，面对工程款长时间未结算的问题，您需要保留证据、友好协商、向相关部门投诉或申请调解、依据合同条款选择仲裁或诉讼，并注意诉讼时效和程序规定。希望这些建议能够帮助您有效地维护自己的合法权益。