总包单位自行招标是否合法，需根据具体情况判断。

一. 自行招标的条件

1. 依法必须进行招标的项目，招标人自行办理招标事宜的，应当具有编制招标文件和组织评标的能力，具体包括：

    - 具有项目法人资格（或者法人资格）；
    - 具有与招标项目规模和复杂程度相适应的工程技术、概预算、财务和工程管理等方面专业技术力量；
    - 有从事同类工程建设项目招标的经验；
    - 设有专门的招标机构或者拥有3名以上专职招标业务人员；
    - 熟悉和掌握招标投标法及有关法规规章。
   

2. 依据《工程建设项目自行招标试行办法》第四条，招标人自行招标应当符合国家有关法律法规和规章的规定，并需向相关行政监督部门备案。

二. 自行招标的合法性分析

• 若总包单位满足上述自行招标的条件，并按照规定进行了备案，则其自行招标是合法的。
• 若总包单位不满足自行招标的条件，或者未按照规定进行备案，则其自行招标是不合法的，可能会面临相关行政监督部门的处罚。

三. 特殊情况

• 对于某些特定的工程项目，如涉及国家安全、国家秘密或者抢险救灾等特殊情况，可能会有特殊的招标规定，此时需根据具体情况判断总包单位自行招标的合法性。

我建议，总包单位在决定自行招标前，应仔细审查自身是否满足自行招标的条件，并按照规定向相关行政监督部门备案。如有进一步需要，您可以继续咨询我。