“协议中赔偿金额不少于支付金额”这句话的意思是，在协议中约定的赔偿金额应当大于或等于已经支付的金额。换句话说，如果因为某种原因需要赔偿，那么赔偿的数额至少要覆盖掉已经支付出去的钱款，不能少于这个数额。

这里我举个例子来帮助你更好地理解：

假设甲乙双方签订了一份合同，甲方需要向乙方支付10万元作为某项服务的费用。后来因为甲方的原因导致合同无法履行，需要向乙方赔偿。如果协议中约定“赔偿金额不少于支付金额”，那么甲方赔偿给乙方的钱款至少要达到10万元，可以更多，但不能少于10万元。

这样的约定通常是为了保障受损方的利益，确保其在遭受损失时能够得到足够的补偿。如果你在实际操作中遇到了类似的情况，或者对协议中的其他条款有疑问，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的解答。