扣员工一千工资是否合法，需根据具体情况而定。以下是一些常见情形及对应的法律解析：

1. 员工因自身原因给单位造成经济损失：

   • 根据《工资支付暂行规定》第十六条，若因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
   • 经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
   • 举例说明：假设员工当月工资为5000元，当地月最低工资标准为2000元，那么因个人原因给单位造成经济损失时，单位每月最多可扣除1000元（5000元的20%），扣除后剩余工资4000元，高于当地月最低工资标准，因此合法。

2. 员工违反公司规章制度：

   • 公司需有合法有效的规章制度，且该制度应经民主程序制定并向员工公示或告知。若员工违反这些明确规定的规章制度，公司可依据规定进行处理。
   • 扣款额度同样需合理且符合法律规定，每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
   • 举例说明：假设员工当月工资为5000元，当地月最低工资标准为2000元，因违反公司规章制度被扣款，单位每月最多可扣除1000元（5000元的20%），扣除后剩余工资4000元，高于当地月最低工资标准，因此合法。

3. 法定代扣情形：

   • 根据《工资支付暂行规定》第十五条，有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
     • 用人单位代扣代缴的个人所得税；
     • 用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
     • 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
     • 法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
   • 在这些法定代扣情形下，扣款金额和方式需严格按照相关法律法规执行，若因这些原因扣款一千元，且符合法定程序和标准，则合法。

4. 其他非法扣款情形：

   • 若单位无故克扣员工工资，或扣款额度超过法定标准，或扣款后的剩余工资低于当地月最低工资标准，均属于违法行为。
   • 员工有权通过与公司协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式维护自身合法权益。

综上所述，扣员工一千工资是否合法需根据具体情况分析。若扣款符合法定情形和额度限制，则合法；若存在违法扣款情形，员工应及时采取措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。