建筑工程施工单位侵权确实可能会影响投标。以下是对此问题的详细分析：
诚信与诉讼情况的影响：
- 在投标过程中，招标公司通常会先查询投标公司的诚信与诉讼情况。
- 如果施工单位存在侵权行为，且被起诉后判决结果不利于公司，这将作为不良记录被记录在案。
- 这种不良记录会影响公司的信誉，进而降低其在投标中的竞争力。
不良行为记录的影响：
- 根据《全国建筑市场各方主体不良行为记录认定标准》，施工单位的不良行为记录包括资质不良、承揽业务不良、工程质量不良、工程安全不良等。
- 侵权行为很可能被归类为承揽业务不良或工程质量不良，这将直接影响施工单位的投标资格。
- 一旦被认定为有不良行为记录，施工单位在投标时可能会受到限制，甚至被禁止参与某些项目的投标。
法律后果与建议：
- 施工单位应严格遵守法律法规，避免侵权行为的发生。
- 如果已经发生侵权行为，应尽快采取措施进行补救，如与受害方协商赔偿、积极履行法院判决等。
- 同时，施工单位应加强内部管理，提高法律意识，确保在未来的经营活动中不再发生类似问题。
综上所述，建筑工程施工单位的侵权行为不仅会影响其当前的投标活动，还可能对其未来的市场声誉和业务发展造成长期负面影响。因此，施工单位应高度重视侵权行为的法律风险，并采取有效措施加以防范和应对。