公司破产时，不直接持股的实际控制人也可能需要承担相应责任。具体责任类型分析如下：
民事责任：
- 如果实际控制人滥用控制权或损害公司利益，导致公司破产，他们可能需要对公司债务承担连带清偿责任。这意味着，尽管实际控制人不直接持股，但债权人仍有可能向其追讨债务。
刑事责任：
- 若实际控制人涉及欺诈破产、隐匿财产等违法犯罪行为，可能构成虚假破产罪等，将面临刑事处罚，如有期徒刑等。这种责任与是否直接持股无关，而是基于其实际控制地位和行为性质。
行政责任：
- 实际控制人还可能因违反相关行政法规，如未依法披露公司信息等，被行政机关处以罚款等处罚。这种责任同样不因其不直接持股而免除。
综上所述，公司破产时，不直接持股的实际控制人也可能因其在公司运营中的实际控制地位和行为性质，而需要承担民事、刑事或行政责任。因此，实际控制人在公司运营过程中应谨慎行事，遵守法律法规，以避免可能的法律责任。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。