盖房主与建筑队签安全协议是有效的。以下是对这一结论的详细阐述：
在房屋建设过程中，盖房主（通常指业主或建设单位）与建筑队（即施工单位）之间签订安全协议，是双方为了确保施工安全、明确各自权利义务而采取的一种常见做法。这种安全协议，只要其内容不违反法律法规的强制性规定，且是双方真实意思的表示，就具有法律效力。
协议内容：安全协议应明确双方在施工安全方面的具体责任和义务，包括但不限于施工安全措施、安全教育培训、事故处理流程、违约责任等。这些内容应当详细、具体，以便在发生争议时有据可依。
法律效力：根据《中华人民共和国合同法》（虽已废止，但相关原则在新颁布的《民法典》中仍有体现）的规定，依法成立的合同，自成立时生效。因此，只要盖房主与建筑队签订的安全协议符合合同成立的要件（即双方具有相应的民事行为能力、协议内容合法、意思表示真实），该协议就具有法律效力。
实际作用：签订安全协议不仅有助于明确双方的责任和义务，还能在一定程度上预防施工安全事故的发生。一旦发生安全事故，协议中的相关条款也可以作为处理事故、追究责任的依据。
综上所述，盖房主与建筑队签订的安全协议是有效的，且对于保障施工安全、维护双方合法权益具有重要意义。因此，在房屋建设过程中，建议双方务必签订详细、合法的安全协议。