当机动车与电瓶车发生交通事故，且电瓶车承担主要责任、机动车承担次要责任时，对于乘车人的赔偿问题，我们可以按照以下流程进行理解和处理：
一、赔偿原则
赔偿将依据双方所应承担的责任比例进行分配。通常情况下，电瓶车一方将承担大部分（如70%）的赔偿责任，而机动车一方则承担较小部分（如30%）的赔偿责任。但具体的比例会根据实际情况进行调整，以确保赔偿的公正合理性。
二、赔偿流程
交强险赔付：
- 双方应首先通过各自的交强险进行赔付。交强险是不按责任比例进行分项限额赔付的，它有一定的赔偿限额，如医疗费用赔偿限额、伤残赔偿限额和财产损失赔偿限额。
- 在这些限额内，交强险将先行赔付乘车人的相关损失，如医疗费用、伤残费用等。
超出交强险部分的赔付：
- 若交强险赔付后仍有超出部分，这部分将按照双方的责任比例进行分担。
- 电瓶车一方将承担大部分（如70%）的超出费用，而机动车一方则承担剩余部分（如30%）。
协商与调解：
- 双方可尝试通过协商或调解的方式解决赔偿问题，以达成双方都能接受的赔偿方案。
诉讼解决：
- 若协商或调解无果，双方可通过诉讼的方式解决赔偿争议。法院将根据事故的具体情况、责任划分以及相关法律法规，作出公正的判决。
三、赔偿项目
赔偿项目可能包括但不限于：
- 医疗费用：包括乘车人因事故受伤所产生的医疗费、诊疗费、住院费等。
- 误工费用：因事故导致乘车人无法工作而产生的收入损失。
- 护理费用：乘车人因事故受伤需要护理所产生的费用。
- 交通费用：乘车人因事故而产生的交通费用，如救护车费、转院费等。
- 其他相关费用：如住院伙食补助费、必要的营养费、残疾赔偿金（如适用）、残疾辅助器具费（如适用）等。
四、注意事项
- 在处理赔偿问题时，双方应保留好所有相关的证据和文件，以便在需要时进行查证。
- 赔偿金额和比例可能会受到多种因素的影响，如事故的具体情况、双方的保险状况等。
- 如果涉及人员伤残或死亡，赔偿问题可能会更加复杂，建议寻求专业法律帮助。
综上所述，当电瓶车承担主要责任、机动车承担次要责任时，乘车人的赔偿问题将依据双方的责任比例进行分配，并通过交强险、协商或诉讼等方式进行解决。在处理过程中，双方应保留好相关证据，并遵循相关法律法规的规定。