同一法定代表人但不同法人的两家公司之间签订的技术合同可以认定登记。以下是详细分析：

1. 技术合同认定的基本条件与类型：

   • 根据相关规定，技术合同包括技术开发、技术转让、技术咨询和技术服务合同。这些合同的确立是为了明确自然人、法人或其他组织之间在技术活动中的民事权利与义务关系。

2. 同一法定代表人但不同法人实体间的技术合同：

   • 当两家公司具有同一法定代表人但分别为独立法人时，它们之间签订的技术合同属于外部技术合同。
   • 此类合同若基于真实的技术交易需求，交易价格合理，且技术内容明确，符合市场规律，则可通过相关监管机构进行认定登记。

3. 认定登记的意义：

   • 经认定的技术合同可享受税收优惠、信贷支持及奖励等政策。
   • 认定登记有助于完善合同条款，提高履约率，减少因合同不明确而引发的纠纷。
   • 技术合同登记数量及交易额可作为企业资信凭证，有助于提升企业的信誉度和获取银行贷款的便利性。

4. 注意事项：

   • 在签署技术合同时，应确保合同的合法性、真实性及价格的合理性。
   • 若合同涉及关联交易或价格明显不合理，可能引起监管部门的质疑，影响合同的认定和有效性。
   • 建议在签署合同前咨询专业律师，以确保合同的合法性和有效性，避免因合同问题引发的法律风险和纠纷。

综上所述，同一法定代表人但不同法人的两家公司之间签订的技术合同，在满足一定条件下是可以进行认定登记的。这有助于享受政策优惠、完善合同条款并减少纠纷。在签署合同时，请务必确保合同的合法性、真实性及价格的合理性，并咨询专业律师以确保合同的合法性和有效性。