工伤事故认定书如果申请重新认定，工伤部门是会知道的。下面我为您详细解释：

首先，工伤认定的流程通常包括员工申报、工伤部门调查核实、出具工伤认定书等环节。如果员工或用人单位对初次工伤认定结果有异议，可以在规定期限内申请重新认定。

在申请重新认定的过程中，需要向工伤部门提交相关的申请材料，包括重新认定申请书、初次工伤认定书、相关证据材料等。工伤部门在收到这些材料后，会重新对工伤事故进行调查核实，并根据调查结果出具新的工伤认定书。

因此，如果您申请了重新认定，工伤部门在收到您的申请材料后，会知晓您的申请，并启动重新认定的程序。在这个过程中，工伤部门可能会要求您提供进一步的证据材料，或者对您的工伤事故进行进一步的调查。

总的来说，工伤部门是负责工伤认定的专门机构，他们会对工伤事故进行客观、公正的调查和认定。如果您对初次认定结果有异议，可以申请重新认定，工伤部门会根据相关规定和程序进行处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。