辅警骑摩托车巡逻中发生自身事故，单位是否赔偿需根据具体情况分析。以下是从不同角度对此问题的详细解答：

1. 工伤认定角度：

   • 若辅警在巡逻过程中发生的事故被认定为工伤，那么单位应当依据《工伤保险条例》的相关规定进行赔偿。工伤赔偿通常包括医疗费用、康复费用、停工留薪期间的工资、一次性伤残补助金、伤残津贴等。
   • 工伤认定的关键在于事故是否发生在工作时间和工作场所内，以及是否因工作原因受到事故伤害。若辅警是在执行巡逻任务时发生事故，且事故与其工作职责直接相关，则很有可能被认定为工伤。

2. 非工伤情况：

   • 若辅警的事故未被认定为工伤，例如是因为个人原因（如违反交通规则、酒后驾驶等）导致的事故，那么单位通常不承担直接的赔偿责任。
   • 在这种情况下，辅警可能需要通过个人保险（如意外险、医疗险等）来寻求赔偿，或者根据事故的具体情况向相关责任人追究民事赔偿责任。

3. 单位内部规定：

   • 除了法定的工伤赔偿外，有些单位可能还制定了内部的补偿或救助机制，用于对在执行职务过程中受伤的员工提供额外的帮助。
   • 辅警可以查阅所在单位的规章制度或咨询人事部门，了解是否有此类规定，并据此向单位提出相应的申请。

4. 法律建议：

   • 对于辅警来说，在发生事故后，首先应及时就医并保留好相关证据（如事故现场照片、医疗记录等）。
   • 随后，应尽快向单位报告事故情况，并咨询单位的人事或法务部门，了解具体的赔偿流程和所需材料。
   • 若在赔偿过程中遇到争议或困难，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径来维护自己的合法权益。

综上所述，辅警骑摩托车巡逻中发生自身事故后，单位是否赔偿需根据工伤认定情况、单位内部规定以及个人保险情况等多个因素来综合考虑。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。