继父去世，继女有权继承2套房和公司股权，亲生女儿不认同的情况下，继女的继承权仍然受到法律保护。以下是详细分析：

1. 继承权的法律依据：

   • 根据《民法典》第一千一百二十七条，遗产按照下列顺序继承：（一）第一顺序：配偶、子女、父母；（二）第二顺序：兄弟姐妹、祖父母、外祖父母。继承开始后，由第一顺序继承人继承，第二顺序继承人不继承；没有第一顺序继承人继承的，由第二顺序继承人继承。本编所称子女，包括婚生子女、非婚生子女、养子女和有扶养关系的继子女。
   • 继女若与继父形成了扶养关系，则属于有扶养关系的继子女，依法享有继承权。

2. 继承权的平等性：

   • 在继承权上，继女与亲生女儿享有平等的权利。亲生女儿不能因继女的身份而否认其继承权。

3. 继承权的实现：

   • 继父去世后，其遗产（包括2套房和公司股权）应由所有第一顺序继承人共同继承。
   • 若继女与继父形成了扶养关系，则她有权与其他第一顺序继承人（如亲生女儿、配偶等）一起平均分配遗产。

4. 处理建议：

   • 若亲生女儿对继女的继承权有异议，建议通过协商或法律途径解决。
   • 协商不成时，继女可以依法向法院提起诉讼，请求确认其继承权并分割遗产。

5. 特殊情况说明：

   • 若继女与继父未形成扶养关系（如继父与继女之母结婚时，继女已成年并独立生活），则继女可能不享有继承权，具体需根据实际情况判断。

综上所述，继女在继父去世后，若与继父形成了扶养关系，则依法享有继承权，包括2套房和公司股权。亲生女儿不认同并不能改变这一法律事实。若存在争议，建议通过法律途径解决。