当民事案件存在两个法院均有管辖权时，处理方式主要遵循《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定。以下是具体的处理方法和分析：

结论前置

民事案件若两个法院均有管辖权，原告可以选择向其中一个法院起诉；若原告向两个法院都提起了诉讼，则由最先立案的法院管辖。

法律规定与原则

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十六条：“两个以上人民法院都有管辖权的诉讼，原告可以向其中一个人民法院起诉；原告向两个以上有管辖权的人民法院起诉的，由最先立案的人民法院管辖。”这一规定明确了在多个法院有管辖权时的选择原则和冲突解决机制。

具体处理方式

1. 原告选择起诉法院：

   • 原告有权在两个或多个有管辖权的法院中选择一个进行起诉，以保障其诉讼便利性和选择性。

2. 避免重复起诉：

   • 原告应避免同时向两个或多个有管辖权的法院提起诉讼，以免造成司法资源的浪费和诉讼程序的混乱。

3. 最先立案法院管辖：

   • 如果原告不慎向两个或多个有管辖权的法院提起了诉讼，应由最先立案的法院进行管辖。其他法院在发现后，应依法将案件移送至最先立案的法院。

4. 法院间的协调与移送：

   • 在实际操作中，如果两个或多个法院之间对管辖权发生争议，可以报请它们的共同上级人民法院指定管辖。
   • 如果受理案件的法院发现自己无管辖权，而原告又不同意将案件移送给有管辖权的法院时，法院也可以依职权裁定将案件移送到有管辖权的法院。

5. 尊重当事人协议管辖（如适用）：

   • 根据《民事诉讼法》的规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反级别管辖和专属管辖的规定。
   • 在存在有效协议管辖的情况下，应优先遵循当事人的约定。

综上所述，当民事案件存在两个法院均有管辖权时，原告应依据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，合理选择起诉法院，并避免重复起诉。若发生管辖权争议，应依法协调解决。