针对“合同约定以票据付款，法院如何判决”的问题，这主要取决于合同的具体条款、双方的实际履行情况，以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细解答：
一、合同约定与票据付款
合同明确约定：
- 当合同中明确约定了以票据（如商业承兑汇票）作为付款方式时，法院通常会尊重这一约定，并将其作为裁决的主要依据。
- 如果合同进一步规定了票据的交付、承兑等具体流程，法院在判决时会严格遵循这些规定。
票据的性质与作用：
- 票据（特别是商业承兑汇票）在法律上具有支付和结算的功能，一旦交付并被接受，通常视为付款义务的履行。
- 然而，票据的兑付风险也需考虑，如票据到期不能兑付，将涉及票据追索权的问题。
二、法院判决的考量因素
实际履行情况：
- 法院会审查双方当事人的实际履行状况，包括票据的交付、承兑情况，以及是否存在违约行为。
- 如果一方未能按照合同约定交付或承兑票据，法院将结合具体情况判断其是否构成违约。
行业交易习惯：
- 法院在判决时也会考虑相关行业的交易习惯，以判断合同约定的票据付款方式是否符合行业惯例。
损失与影响：
- 法院会评估未按照协议开具或承兑票据行为给另一方所带来的损失和影响。
- 如果该行为对另一方的财务核算、税收抵扣等方面产生了重大影响，法院可能更倾向于支持提出抗辩的一方。
三、特殊情形下的判决
票据拒付：
- 如果票据到期被拒付，收款方通常不能直接依据合同追究付款方的违约责任，而应行使票据追索权。
- 但需注意的是，票据追索权有特定的行使期限和方式，如未能在规定期限内通过法定方式行使，则可能丧失追索权。
合同与票据的竞合：
- 在某些情况下，合同债权与票据债权可能同时存在。此时，法院将根据具体事实和法律规定判断何种债权应优先得到保护。
四、建议与总结
明确合同约定：
- 在签订合同时，应明确约定票据的付款方式、交付与承兑流程，以及违约责任等条款。
- 尽量避免只约定以票据作为唯一付款方式，建议约定的付款方式多元化，以降低风险。
注意票据风险：
- 在接受票据作为付款方式时，应充分了解票据的性质、风险及兑付流程。
- 如遇票据拒付等情形，应及时行使票据追索权或采取其他法律措施保护自身权益。
综上所述，法院在判决合同约定以票据付款的案件时，将综合考虑合同的具体条款、双方的实际履行情况、相关法律法规及行业交易习惯等多个因素。因此，在签订和履行合同过程中，双方应谨慎行事，明确约定并严格遵守相关法律法规和合同条款。