两家亲子鉴定机构的数据不会互通。以下是对这一结论的详细解释：

1. DNA数据库不存在互通：

   • 不同的亲子鉴定机构之间并不会共用或共享一个DNA数据库。每个机构都有自己的数据管理系统，且这些数据是独立的，不会与其他机构进行互通。

2. 成本高且不具备操作性：

   • 建立和维护一个DNA数据库需要高昂的成本，包括技术、设备和人力等方面的投入。因此，从经济角度来看，亲子鉴定机构通常不会选择建立这样的数据库。
   • 此外，DNA数据的命名和编码方式并没有统一的规则，这使得不同机构之间的数据很难进行对接和共享。即使存在数据库，也会因为命名规则的不同而导致数据检索和匹配的困难。

3. 保护公民个人隐私：

   • DNA信息属于个人隐私范畴，受到法律的保护。任何机构或个人都不得非法获取、使用或泄露他人的DNA信息。因此，亲子鉴定机构在处理DNA数据时，会严格遵守相关法律法规，确保数据的保密性和安全性。

4. 公安系统DNA数据库的特殊性：

   • 需要注意的是，虽然公安系统确实建立了DNA数据库，但这主要是用于刑事侦查和司法鉴定等特定目的。这些数据库的管理和使用都受到严格的法律监管，且只有具备相应权限的机构和人员才能访问和使用。
   • 亲子鉴定机构作为独立的第三方机构，并不具备访问公安系统DNA数据库的权限。

综上所述，两家亲子鉴定机构的数据是不会互通的。如果你对亲子鉴定有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。