当公司资金被法人股东侵占时，这是一个严重的问题，需要采取一系列措施来维护公司的权益。以下是一些详细的步骤和建议：

一、明确侵占行为及法律依据

首先，要明确法人股东的侵占行为，这可能包括挪用资金、职务侵占等。这些行为违反了《中华人民共和国公司法》、《中华人民共和国刑法》等相关法律法规。例如，《刑法》第二百七十一条就明确规定了职务侵占罪的构成和处罚。

二、采取的具体应对措施

1. 内部协商与沟通

   • 尝试与法人股东进行沟通，了解其侵占行为的具体情况和动机，看是否有和平解决的可能性。
   • 组织股东会、董事会或监事会会议，讨论并表决对侵占行为的处理意见，形成正式的决议。

2. 收集证据

   • 这一步至关重要。要聘请专业审计机构对公司财务进行全面审计，查明资金流向，确认侵占事实。
   • 妥善保管相关证据材料，如财务账目、银行流水、电子邮件、合同协议等。这些证据将在后续的法律程序中起到关键作用。

3. 法律途径维权

   • 若侵占行为涉嫌犯罪，可向公安机关经济犯罪侦查部门报案，提供相关证据材料，追究其刑事责任。
   • 提起民事诉讼，要求法人股东返还被侵占的资产，并赔偿因此给公司造成的损失。这可以通过股东代表诉讼或侵权赔偿诉讼来实现。
   • 向市场监管部门、税务部门等行政机关举报法人股东的违法违规行为，要求其承担相应的行政责任。

4. 公司治理机制

   • 依据公司章程和法律规定，通过合法程序罢免存在侵占行为的法人股东或相关董事的职务。
   • 完善公司治理结构和监督机制，增设风险防控条款，防止类似事件再次发生。

5. 寻求外部支持

   • 委托专业律师提供法律咨询和代理诉讼服务，确保公司的法律权益得到充分保护。
   • 考虑通过行业协会或第三方调解机构进行争议调解，以寻求更为和平和高效的解决方案。

三、注意事项

• 及时行动：发现侵占行为后应尽快采取措施，避免损失进一步扩大。
• 保护证据：确保证据材料的真实性和完整性，防止被篡改或销毁。这是后续法律程序成功的关键。
• 合规操作：所有维权行为都需符合法律法规和公司章程的规定，避免引发次生法律风险。

综上所述，当公司资金被法人股东侵占时，应通过内部协商、收集证据、法律途径维权、完善公司治理机制和寻求外部支持等多方面的措施来维护公司的权益。同时，要注意及时行动、保护证据和合规操作的重要性。