首先，我们要明确一点：在工程项目中，使用方不是甲方的情况并不罕见，这通常涉及到合同关系的复杂性和多样性。针对这种情况，办理手续的关键在于明确各方的权利义务，并确保所有手续都符合法律法规的要求。

1. 明确合同关系：

   • 首先，需要仔细审查与工程项目相关的所有合同，包括但不限于工程承包合同、设备采购合同、服务合同等，以确定使用方、甲方、乙方等各方的具体身份和角色。
   • 如果使用方不是甲方，那么需要明确使用方与甲方、乙方之间的合同关系，以及使用方在项目中具体承担的权利和义务。

2. 办理相关手续：

   • 根据合同中的约定，以及工程项目的具体性质和要求，使用方可能需要办理一系列的手续，如项目审批、用地许可、规划许可、施工许可等。
   • 这些手续的办理通常需要遵循一定的程序和规定，使用方应当与甲方、乙方等相关方密切沟通，确保手续的顺利办理。
   • 如果使用方缺乏办理这些手续的经验或能力，可以考虑委托专业的第三方机构或律师事务所提供协助。

3. 注意法律风险：

   • 在办理手续的过程中，使用方应当特别注意可能存在的法律风险，如合同违约、侵权纠纷、行政处罚等。
   • 为了防范这些风险，使用方应当加强合同管理，确保合同的履行符合法律法规的要求；同时，也可以考虑购买相应的保险产品或寻求法律援助，以应对可能出现的法律纠纷。

4. 与相关部门沟通：

   • 在办理手续的过程中，使用方可能需要与多个政府部门进行沟通和协调，如建设部门、规划部门、土地管理部门等。
   • 为了确保手续的顺利办理，使用方应当积极与这些部门保持联系，及时了解政策动态和办理要求，并积极配合相关部门的工作。

综上所述，工程项目使用方不是甲方时，办理手续的关键在于明确合同关系、遵循相关程序和规定、注意法律风险以及与相关部门保持沟通。如果您在具体操作中遇到任何问题或困难，可以随时向我咨询，我会尽力为您提供专业的法律帮助和建议。