关于“工程款优先权在法院的调解书中没有约定，破产管理人能否认定”的问题，我们可以从以下几个方面进行分析和回答：

核心结论：工程款优先权作为法定优先权，其存在并不完全依赖于法院的调解书或判决书的明确约定。破产管理人在处理破产案件时，应当依据相关法律规定，对工程款优先权进行认定。

分析说明：

1. 工程款优先权的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，工程款优先权是承包人依法享有的，对其承建的工程折价或拍卖所得价款享有优先受偿的权利。
   • 这一权利是法定的，不以当事人的约定为转移，即使法院的调解书中没有明确约定，也不影响其存在和行使。

2. 破产管理人的职责：

   • 破产管理人在破产程序中，负责管理和处分破产财产，包括但不限于对破产财产的变现、分配等。
   • 在处理破产财产时，破产管理人应当遵循法律规定，对各类债权进行清理和认定，包括工程款优先权。

3. 工程款优先权的认定：

   • 破产管理人在认定工程款优先权时，应当审查承包人是否具备行使优先权的条件，如工程是否已竣工、是否已结算等。
   • 如果承包人符合行使优先权的条件，破产管理人应当依据法律规定，对工程款优先权进行认定，并在破产财产分配中予以优先考虑。

4. 实践中的操作：

   • 在实践中，即使法院的调解书中没有明确约定工程款优先权，破产管理人仍然应当依据相关法律规定进行认定。
   • 如果破产管理人拒绝认定或处理不当，承包人可以依法向法院提起诉讼或申请仲裁，以维护自己的合法权益。

综上所述，工程款优先权作为法定优先权，其存在和行使并不完全依赖于法院的调解书或判决书的明确约定。破产管理人在处理破产案件时，应当依据相关法律规定，对工程款优先权进行认定，并在破产财产分配中予以优先考虑。如果破产管理人处理不当，承包人可以依法采取法律措施维护自己的权益。