弄虚作假退税1000元是有可能被查出来的。以下是对此问题的详细分析：

一. 税务机关的查处权力

根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十四条的规定，纳税人、扣缴义务人编造虚假计税依据的，由税务机关责令限期改正，并处五万元以下的罚款。这表明，对于包括退税在内的所有税务事项，税务机关都有权进行核查，并对违法行为进行处罚。

二. 税务机关的查处方式

税务机关可以通过多种方式查到个人所得税的作假行为，包括但不限于：

1. 税务机关的抽查：税务机关会定期对纳税人的申报情况进行抽查，以核实其真实性。
2. 信息比对：税务机关会通过各种税务和非税务信息的比对，来核查纳税人的申报情况。
3. 接受举报和投诉：税务机关也会接受其他人的举报和投诉，对涉嫌违法的行为进行调查。

三. 退税金额与查处可能性的关系

虽然退税金额1000元相对较小，但这并不意味着税务机关就不会进行查处。税务机关的查处行为是基于对税收法律法规的维护和对税收秩序的保障，而不是基于退税金额的大小。因此，无论退税金额多少，只要存在弄虚作假的行为，都有可能被税务机关查处。

四. 弄虚作假退税的后果

如果纳税人被查实存在弄虚作假退税的行为，将面临税务机关的行政处罚，包括责令限期改正和罚款。同时，这种行为还可能对纳税人的信用记录造成不良影响，导致在未来办理其他税务或相关业务时受到限制或不利影响。

我的观点：弄虚作假退税是违法行为，无论退税金额多少，都有可能被税务机关查处。纳税人应严格遵守税收法律法规，如实申报纳税和退税信息，以避免不必要的法律风险和信用损失。如有进一步需要，您可以继续咨询我。