肇事逃逸后双方调解，交强险是否报销，需根据具体情况分析。

1. 交强险的赔付原则：交强险主要是为交通事故中的受害者提供基本的赔偿保障，其赔付通常不依赖于事故双方是否达成调解。然而，肇事逃逸是一种违法行为，它可能影响交强险的赔付。

2. 肇事逃逸对交强险赔付的影响：

   • 如果肇事者逃逸后被查明，并且交强险公司认定该事故属于保险责任范围，那么交强险公司仍然有可能对受害者进行赔付，但可能会保留向肇事者追偿的权利。
   • 在某些情况下，如果肇事逃逸导致事故责任无法清晰认定，交强险公司可能会拒绝赔付，或者只进行部分赔付。

3. 双方调解对交强险赔付的影响：

   • 双方调解主要解决的是事故双方之间的民事赔偿责任问题，它并不直接决定交强险是否赔付。
   • 如果调解协议中明确包含了交强险的赔付内容，并且该协议得到交强险公司的认可，那么交强险公司可能会按照协议进行赔付。

4. 建议：

   • 在发生肇事逃逸事故后，受害者应尽快报警并联系交强险公司，以便及时了解赔付政策和流程。
   • 如果双方达成调解，建议将调解协议内容告知交强险公司，并咨询其是否认可该协议中的赔付条款。

综上所述，肇事逃逸后双方调解并不直接影响交强险的赔付，但肇事逃逸行为和调解协议的具体内容可能会影响交强险公司的赔付决策。因此，在处理此类问题时，建议受害者与交强险公司保持密切沟通，并咨询专业律师以获取更准确的法律意见。如果你还有其他法律问题，可以直接向我咨询。